2009 zal voor het IWT voor altijd het jaar zijn waarin Paul Zeeuwts is overleden. Er volgde een moeilijke periode voor het IWT, een tijdperk van bijna 20 jaar diende te worden afgesloten.
2009 was voor het IWT het laatste jaar in zijn oude statuut van VOI of Vlaamse Openbare Instelling. Vanaf 2010 is het IWT als extern agentschap^? geïntegreerd in de structuur van de Vlaamse overheid^? na het Beter Bestuurlijk Beleid traject.