Alle kosten voor personeelsleden die onderzoeksactiviteiten uitvoeren in het kader van het project, kunnen op de projectbegroting ingebracht worden. De kosten voor personeel voor ondersteunende taken - secretariaat, boekhouding, aankoop, onderhoud, enz.  - en voor algemeen leidinggevend en toezichthoudend personeel kunnen evenwel niet worden ingebracht.

De personeelskosten omvatten de reële brutolonen die uitbetaald worden, de wettelijke werkgeversbijdragen, de bijdrage voor de wettelijke verzekeringen, elke andere wettelijk verplichte vergoeding of toelage bij de wedde en andere voordelen zoals algemeen gangbaar.

Onderzoeksinstellingen kunnen enkel personen op een project budgetteren die niet reeds via andere overheidsbronnen betaald worden. Zelfstandig en Assisterend Academisch Personeel aan universiteiten, doctoraatsbursalen, onderzoeksmandatarissen, docenten met een vast contract aan hogescholen,... die reeds een verloning krijgen via andere overheidsfinancieringsbronnen, kunnen enkel pro-memorie meewerken. 

De overige projectkosten bestaan enerzijds uit de directe kosten voor werkingsmiddelen en uitrustingsgoederen, anderzijds uit indirecte kosten. Deze worden zo correct mogelijk ingeschat en gemotiveerd. Het TETRA-fonds voorziet maximaal een bedrag van 37.500 euro per voltijdsequivalent per jaar.

Het TETRA-fonds voorziet geen middelen voor investeringen in basisinfrastructuur. Die kunnen wel afgeschreven worden in functie van de bezetting voor het project. Kleinere investeringen kunnen volledig in de begroting opgenomen worden. Voor investeringen vanaf 5.000 euro wordt een offerte voorzien.

Onderaannemingen moeten in principe onder de werkingskosten begrepen worden. Grote onderaannemingen, vanaf 5.000 euro, worden afzonderlijk begroot en zijn voorzien van een offerte. De totale onderaannemingskost blijft beperkt tot 10% van de totale projectbegroting.